Investigadores de CIC bioGUNE desarrollan una aplicación bioinformática que ayuda a interpretar los microRNAs
Un equipo de investigadores de la Unidad de Genómica Funcional de CIC bioGUNE, liderado por la investigadora Ana María Aransay, ha desarrollado una herramienta bioinformática que permite analizar e interpretar los resultados de la secuenciación de microRNAs o pequeños RNAs no codificantes -moléculas de ácido ribonucleico transcritas a partir de genes de ADN que no son traducidas a proteínas-. Se trata de una herramienta web de acceso libre y gratuito denominada ‘miRanalyzer’ que ha tenido un gran impacto desde que fuera publicada en mayo en la revista Nucleic Acids Research.
Los microRNAs (también denominados miRNAs) son pequeñas moléculas (de entre 19 y 25 nucleótidos) de ácido ribonucleico (RNA), transcritas a partir de regiones específicas de DNA, las cuales no son traducidas a proteínas y a las que, hasta hora, se les han adjudicado funciones reguladoras. Los miRNAs se expresan en una amplia variedad de organismos, desde plantas hasta gusanos y humanos. Muchos miRNAs están bien conservados a lo largo de la evolución, lo que revela que su origen es muy antiguo. Algunos recuentos han identificado hasta 800 miRNAs diferentes en humanos, lo que implica que el conjunto de miRNAs podría representar alrededor del 3% del genoma humano.
El estudio de miRNAs resulta de gran utilidad para empezar a comprender ciertos eventos celulares que hasta ahora no se podían explicar, como por ejemplo la regulación de la expresión de determinados genes en células cancerígenas o la modulación de la respuesta inmune innata. Del mismo modo, es muy interesante la descripción del contenido de miRNAs en los distintos órganos humanos para estudiar si juegan algún papel en la respuesta individual a ciertos tratamientos farmacológicos.
Hasta ahora, los investigadores que no contaban con el apoyo de grupos bioinformáticos dependían de terceros para analizar los datos de secuenciación masiva de miRNAs. A partir de la publicación de ‘miRanalyzer’, se puede realizar el análisis desde cualquier laboratorio de manera remota y gratuita. Tal y como afirma Ana María Aransay, “las pautas de utilización de esta herramienta web son muy fáciles, así como la preparación de los ficheros de los datos que se quieren analizar, por lo cual es una herramienta muy comprensible para los que no somos bioinformáticos”.
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Fuente: BIOBASQUE
Foto: BIOBASQUE
By Basquenews @ 1:37 PM :: 253 Views